Sommaire
 1- Tuberculose
 2- Lèpre - Ulcère de Buruli
 3- Mycobactérioses
 4- Autres activités (surveillance, recherche, ...)
 Modalités d’envoi des prélèvements

 Souche de mycobactérie du complexe tuberculosis

 Identification au sein du complexe tuberculosis quand les caractères culturaux ne sont pas typiques de M. tuberculosis
 Contrôle de sensibilité aux antituberculeux de 1ère ligne en cas de difficulté d’interprétation des résultats des tests faits dans le laboratoire d’origine
 Test de sensibilité aux antituberculeux de 2ème ligne (kanamycine, amikacine, capréomycine, ethionamide, fluoroquinolones) et au pyrazinamide, en cas de résistance à la rifampicine

 Détection moléculaire de la résistance aux antituberculeux

A partir d’une souche ou à partir d’un prélèvement dans lequel il y a plusieurs baar/champ (objectif x25, coloration à l’auramine)
 Analyse du gène rpoB quand la souche est suspecte d’être résistante à la rifampicine
 Analyse des gènes pncA (pyrazinamide), gyrA et gyrB (fluoroquinolones) systématique pour toutes les souches multirésistantes (résistantes à l’isoniazide et à la rifampicine dites MDR)
 Analyse des gènes katG et inhA quand le résultat phénotypique de la sensibilité à l’isoniazide est ininterprétable

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 Tests phénotypiques de sensibilité aux antituberculeux à partir d’une expectoration à examen microscopique positif (baar +)

 Identification moléculaire de M. tuberculosis et antibiogramme "direct" à partir d’un prélèvement positif à l’examen microscopique (plusieurs baar/champ, coloration à l’auramine, objectif x25 et volume de prélèvement décontaminé > 3ml), en cas de suspicion de multirésistance (contacter le CNR pour mettre au point les aspects logistiques) _

 Empreinte digitale génomique

 Epidémie :

• • - A partir de 1 cas nosocomial (doit être l’objet d’un signalement à la DDASS) : souche du cas et souches des contaminateurs potentiels
  • - Cas communautaires groupés, en particulier dans le cadre des enquêtes autour d’un cas (selon demandes DDASS)

 Suspicion de contamination de laboratoire :

• • - 1 ou 2 cas à examen microscopique négatif et culture faiblement positive (MoC+) analysés le même jour que la mise en culture d’un cas avec examen microscopique positif et culture fortement positive (M+C+)
  • - si plusieurs cas suspects d’être des contaminations réparties sur plusieurs séries de mise en culture, la priorité est à l’examen détaillé des procédures du laboratoire. Le CNR est à votre disposition pour vous aider dans cet examen.
    
    
     

     Groupe d’aide à la prise en charge des tuberculoses complexes (MDR ...)

  • - Le groupe se réunit 2 fois par mois à une date prédéfinie à l’avance
  • - Pour soumettre un cas clinique, contacter le CNR-MyRMA par courriel (cnr.myctb.psl[a]aphp.fr) ou par téléphone (01 42 16 20 71)
  • - La réunion à lieu dans la Salle de réunion du Laboratoire de Bactériologie-Hygiène (2ème étage du bâtiment de la Pharmacie), Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, 47-83 Bd de l’hôpital, 75013 PARIS (secrétariat 01 42 16 20 70)
  • La réunion a également lieu par visioconférence - le CNR adresse aux participants un lien unique internet avant chaque conférence

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 Diagnostic et tests de sensibilité

 A partir de biopsies cutanées à examen microscopique positif (baar +)

• - Biopsie cutanée pour étude de la sensibilité de Mycobacterium leprae (contacter le CNR pour mettre au point les aspects logistiques)
• - Biopsie cutanée pour recherche de Mycobacterium ulcerans (contacter le CNR pour mettre au point les aspects logistiques)
  
  

RCP Lèpre
 Le CNR-MyRMA organise une RCP pour le diagnostic et le traitement de la lèpre.
 La RCP est coordonnée par le Laboratoire associé (33 1 40 25 70 48 (DECT)/ 71 73 (réception))
 Elle est organisée par visioconférence en contactant au préalable le Dr Faiza Mougari (faiza.mougari(a)aphp.fr ou téléphone ci-dessus) le CNR adresse aux participants un lien unique internet avant chaque conférence
 Les dates de la RCP (une fois/mois) sont ICI
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 Identification

• - Nouveau cas de mycobactériose respiratoire compatible avec la définition d’infection selon les critères de l’American Thoracic Society (référence - cliquer ici) :
  • - en particulier critères microbiologiques : 2 prélèvements positifs en culture à partir de 2 prélèvements ou
  • - matériel de biopsie pulmonaire avec aspects histologiques évocateurs d’infection à mycobactéries (granulome ou BAAR) et positif en culture à mycobactéries ou associé à un prélèvement respiratoire positif à mycobactérie en culture

• • Il est précisé que faire le diagnostic de mycobactériose n’implique pas la mise en route systématique d’un traitement, ce dernier devant être discuté au cas par cas.

 Le CNR-MyRMA organise une RCP (1/mois) pour le diagnostic et le traitement des infections à "mycobactéries atypiques" ou "mycobactéries non-tuberculeuses"(MNT).
 La RCP est coordonnée par le Laboratoire associé (33 1 40 25 70 48 (DECT)/ 71 73 (réception))
 Elle est organisée par visioconférence en contactant au préalable le Dr Faiza Mougari (faiza.mougari(a)aphp.fr ou téléphone ci-dessus) le CNR adresse aux participants un lien unique internet avant chaque conférence
 Les dates de la RCP (une fois/mois) sont ICI

• Identification moléculaire (+/- phénotypique et biochimique si discordance)

Anciens critères de l'ATS (cliquer ici)

 Tests de sensibilité aux antibiotiques

* Nouveaux cas (cf ci dessus)

• Tests de sensibilité recommandés par le GBEA Mycobactéries :
  • A titre d’exemple :
  • -Clarithromycine pour M. avium complex, M. abscessus et M. chelonae
  • -Rifampicine pour M. kansasii et M. szulgaï
  • -Fluoroquinolones pour M. fortuitum complex

* Rechute après traitement

• • -mêmes antibiotiques que ci dessus (s’il ont été utilisés pour le traitement initial)
  • -antibiotiques complémentaires après analyse du cas (à discuter avec un biologiste du CNR)

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Modalités d’envoi des prélèvements : cliquer ici

Toutes les demandes d’analyse doivent être adressées au laboratoire coordonnateur accompagnée de la fiche de renseignement :

 Laboratoire de Bactériologie-Hygiène
CHU Pitié-Salpêtrière
47-83 bd de l’Hôpital
75651 Paris cedex 13
téléphone : 01 42 16 20 70 - secrétariat
télécopie : 01.42.16.20.72
cnr.myctb.psl@aphp.fr

Les résultats sont retournés au demandeur soit par le laboratoire coordonnateur, soit par le laboratoire associé.

 Surveillance de la résistance aux antituberculeux

 Surveillance des formes rares de tuberculose : méningite, tuberculose à M. bovis, ...

 Mécanismes de résistance aux anti-mycobactériens

 Chimiothérapie expérimentale

 Epidémiologie Moléculaire

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